総会	センターの最高決定機関 　年１回９月に開催 （議決権は維持会員のみ）

　

幹事会	センターの運営機関 　　　（代表、副代表、事務局長、研究事務局長、編集長、その他の幹事）

研究部会	日本軍慰安婦問題をはじめとする戦争犯罪・戦争責任 　についての調査研究
編集委員会	『季刊戦争責任研究』の編集 　　　　（センターの調査研究成果の発表）
ボランティア部　＆　『Let's』編集部	連続ゼミの運営や『Let's』の編集発行をはじめ事務局 　とともにセンターを支えています。
事務局	日常の活動をおこなっている縁の下の力持ち。 　国連や日本政府、国会などへの働きかけや、内外の諸団体との協力活動なども。